由于缺乏反复出现的或可预测的DNA生物标记物，针对肉瘤的液体活检技术应用一直充满了挑战，但本周在芝加哥举行的美国临床肿瘤学会上公布的新发现让人们看到了基于血液的肉瘤患者微小残留病变检验的潜在前景。
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肉瘤（英语：sarcoma；希腊语：σ?ρκωμα、sárkomma，源于sárka，意为肉、软组织，词尾~om指肿瘤）或称恶性肉瘤，是一种恶性肿瘤，组织
来源为支持组织，间胚叶组织（准确一点，来自中胚层）。
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MRD（Minimal Residual Disease），即微小残留病病变分子残留病变，是指肿瘤患者经过治疗后，传统影像学(包括PET/CT)或实验室方法不能发现，但通过液体活检发现的癌
来源少量残留癌细胞/分子异常，代表着肿瘤的持续存在和临床进展的可能。
Dana-Farber癌症研究所肿瘤学家和研究员Brian Crompton在讨论这项研究的网络广播中说，这两项研究的数据，其中一项由多伦多玛格丽特公主癌症中心的调查员领导，使用Natera公司的Signatera MRD测定，另一项由中国广州中山大学附属第一医院的研究团队进行，采用类似的肿瘤知情方法，暗示了循环肿瘤DNA（ctDNA）测试如何在肉瘤患者护理中证明有临床用途。
迄今为止，在肉瘤中寻找循环肿瘤DNA的应用一直是个挑战。Crompton说：“在今天这个会场里的每个人可能都很清楚，肉瘤是一项非常引人注目的疾病，它们非常结构化，很少发现反复出现的热点或相同的点突变，这使得它与你反复发现激活的酪氨酸激酶的癌瘤相比，是一个非常不同的挑战。”
不过，研究人员继续探索ctDNA作为预后工具，分析其水平以估计患者是否可能或已经对治疗有反应，以及筛选出罕见的可瞄准的改变，从而为未来的治疗提供信息。
Crompton将ctDNA检测的发展描述为测序深度和广度之间的‘平衡’，“这很重要，特别是在肉瘤中，因为反复突变的基因很少。如果你在一个20个基因总是发生突变的肿瘤类型中工作，你可以很容易地创建一个可以进行极度深入测序的小组…以找到这些变体的存在。但当你不知道你在寻找什么或在每个患者身上期待什么时，就很难开发出一种现成的测定方法来给你提供这种深度[因为]随着你的范围扩大，如果你有固定的成本，就越来越难有你需要的深度来找到非常、非常少量的循环肿瘤DNA。”
ASCO会议上强调的两项研究都采用了所谓的肿瘤知情、患者个性化策略，即放弃通用或现成的样本，而是根据个人的肿瘤组织测序来开发个性化的DNA改变样本。Natera公司以Signatera为品牌提供这种商业测试已有数年，随着时间的推移，也出现了几个拥有类似平台的竞争者。
研究结果
在第一个ASCO报告中，玛格丽特公主医院的调查员Abdulazeez Salawu报告了一项研究的结果，他和他的同事使用Signatera为软组织肉瘤（STS）患者建立了MRD测定。
在这项研究中，局部高风险STS患者在放疗和手术前被纳入。研究人员在诊断时、放疗后、手术后以及每三个月收集血样进行ctDNA分析，为期两年。他们还对档案中的肿瘤和匹配的正常组织进行了全外显子组测序（WES），以确定患者特有的体细胞单核苷酸变异。
然后，研究小组使用个性化和肿瘤知情的、基于多重PCR下一代测序的ctDNA（Signatera）检测方法，追踪连续收集的血浆样本中的ctDNA，ctDNA水平以每毫升血浆中平均肿瘤分子（MTM/ml）表示。术后每三个月进行一次放射监测。主要终点是诊断时ctDNA检测率大于70%。次要终点包括局部治疗后的MRD检测以及ctDNA水平与疾病复发的相关性。
该团队能够从20名患者身上收集样本，这些患者有足够的组织质量来进行创建个性化Signatera测定所需的WES。这些检测方法能够检测出80%的ctDNA，即16名初次诊断的患者，其中15人在手术后立即再次检测时成为ctDNA阴性。随访抽血可以检测出重新出现的ctDNA，表明复发，有四名患者在影像学上出现复发前的中位时间为92天。
Crompton提醒说，该研究中对治疗前样本的分析是回顾性的。个性化的MRD检测需要时间来创建，结果可能是肿瘤诊断性或现成的检测方法足以完成最初的预后步骤。
这些针对患者的检测方法的真正优势是在随访方面。Crompton指出：“正如你所看到的…，在这个队列中，有几个病例是在知道患者正在进展之前检测到ctDNA的。”，这使它成为‘进展的预兆’，“这是我们需要开始考虑的研究，我们可以在最终会进展的患者中更早地使用治疗方法，希望能极大地延长他们的生命，甚至在复发的情况下帮助开始实现治愈。”
表示，这些类型的额外研究已经在进行。
在第二项ASCO研究中，中山大学附属第一医院的研究人员在全外显子组肿瘤组织测序的基础上为84名肉瘤患者创建了类似的个性化MRD检测方法。
Crompton强调了数据中的两个突出的特点。首先，在WES数据中发现的64%的变体只出现在一个患者身上，“他说：”这又回到了肉瘤的基因组学，以及你如何不能依靠反复出现的变体和某些基因来确保你有一个能检测该患者MRD的检测方法。”
其次，值得注意的是，有18名患者，该团队无法为其创建一个具有足够内容的个性化测定。Crompton说，这不一定要被看作是失败，而是“我们在处理肉瘤方面的现实”的更多证据，“我认为他们能够在知道这些肿瘤在结构上是如何驱动的情况下开发出这么多的检测方法，这实际上是相当了不起的。”
与玛格丽特公主小组一样，中山大学研究小组也能够表明，检测ctDNA往往是复发的预兆，而且，尽管没有MRD并不能完全预测持续的无病生存，但也有关联。
研究小组对27名患者进行了手术后MRD检测，其中8名患者的检测结果为阳性。其中三人在检测出MRD阳性后的12天、30天和101天分别出现了经影像学证实的复发。据研究者称，到目前为止，其他患者没有再发生影像学上的复发，包括其余5名检测为阳性的患者和19名术后MRD阴性的患者。随访仍在进行中。
Crompton说：“我认为这里的总体结论是，肿瘤特异性测试在肉瘤中是可行的，这是该领域之前没有真正探索过的东西。当然，还需要更多的数据来证明这种测试具有真正的临床效用。这些研究确实刚刚出现，但我认为看到这里的成功确实令人激动和鼓舞。现在我们需要考虑更大规模的研究，以确定特异性和敏感性，并确保每次抽血都与成像相吻合，这样我们就知道……这些检测方法实际上提供了多少准备时间。”
最后，他建议未来的工作也要评估在肉瘤的不同亚型背景下效用的变化，“其中一些肿瘤[如第二项研究所证明的]可能有如此少的SNVs，以至于开发针对患者的检测方法实际上是不可行的，而其他肿瘤可能更成功。”
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来源：周叔说生活
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