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美国国立综合癌症网络(NCCN)每年发布的各种恶性肿瘤临床实践指南,获得了全球临床医师的认可,也已成为全球肿瘤临床实践中应用最为广泛的指南。
5大融合基因被指南推荐
多种融合基因检测已被纳入NCCN指南常规推荐。例如在2022版的《非小细胞肺癌NCCN指南》中明确指出[1],对于通过多基因NGS检测未发现驱动基因突变的患者,建议进行RNA-NGS检测,从而更大程度地发现融合事件。
对于晚期非小细胞肺癌,NCCN指南推荐的融合/重排检测的基因就有5项:ALK基因重排,MET外显子14跳跃突变,ROS1基因重排,RET基因重排,NTRK1/2/3基因融合。
NCCN推荐的融合基因
- ALK基因重排
ALK重排会导致ALK激酶结构域的调节异常和信号传导不当,约5%的NSCLC患者存在ALK基因重排[2]。
- MET14号外显子跳跃突变
MET 14号外显子跳跃突变会导致其编码的蛋白近膜结构域缺失,最终导致下游信号通路的持续激活,从而导致肿瘤发生。约3%-6%的NSCLC患者存在MET14外显子跳跃突变[3]。
- ROS1基因重排
ROS1 有许多融合伴侣,常见的融合伴侣包括:CD74、SLC34A2、CCDC6 和 FIG。约1%-2%的NSCLC患者存在ROS1基因重排[4]。
- RET基因重排
约1.6%的中国NSCLC患者携带RET基因重排[5],无论融合伴侣的类型,患者均可从RET TKI中获益。
- NTRK1/2/3基因融合
NTRK基因融合在NSCLC中的发生率为0.3%[6],通常不与EGFR、ALK或ROS1等其他驱动基因同时发生突变。
融合基因的分子诊断检测方法
针对融合基因的分子诊断方法,2022年版的NCCN指南中对NGS检测法进行了具体的推荐。可行的条件下,广泛检测最常用的技术是NGS,对于广泛检测无可识别的驱动基因的患者(尤其是从不吸烟的患者),可考虑基于RNA的NGS(如果尚未进行),以最大程度检测融合事件。
指南也特别指出针对MET14号外显子跳跃突变和RET基因重排,推荐使用RNA-NGS进行检测,比DNA-NGS更具检测优势。
“对于MET14号外显子跳跃突变,NGS是检测METex14跳跃突变的主要方法,RNA-NGS在检测方面表现出优势。”
“对于RET基因重排,基于NGS的方法特异性高,对于融合检测,基于RNA的NGS优于基于DNA的NGS。”
在2022版《结直肠癌NCCN指南》中[7],专家也建议对于已用IHC检测NTRK融合阳性的患者,由于检测方法的局限性可能存在假阳性率高的现象,故而推荐再用RNA-NGS确诊。NCCN指南的推荐体现出了融合基因检测的重要性,通过融合检测最大化的匹配靶向用药,已经成为肿瘤精准治疗的中流砥柱。
结语
路胜LiquidHALLMARK? ctDNA+ctRNA检测方案涵盖ctDNA层面的80个基因,ctRNA层面的27个重要基因融合。基于ctDNA+ctRNA联合检测可以更灵敏地检出具有临床意义的、新兴的融合基因,指导进行精准的治疗决策。
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参考文献
[1] 2022版NCCN非小细胞肺癌指南https://www.nccn.org/professionals/physician_gls/pdf/nscl.pdf
[2] Arbour KC, Riely GJ. Diagnosis and Treatment of Anaplastic Lymphoma Kinase-Positive Non-Small Cell Lung Cancer. Hematol Oncol Clin North Am. 2017 Feb;31(1):101-111.
[3]尹利梅,卢铀. MET 14外显子跳跃突变在非小细胞肺癌中的研究进展[J]. 中国肺癌杂志.2018;7(21):553-559.[6]NCCN Clinical Practice Guidelines in Oncology (NCCN Guidelines?)Non-Small Cell Lung Cancer Version 6.2021
[4] 中国临床肿瘤学会指南工作委员会.中国临床肿瘤学会(CSCO)非小细胞肺癌诊疗指南2020[M]. 北京:人民卫生出版社,2020。
[5] Gou, L. Y. & Wu, Y. L. Prevalence of driver mutations in non-small-cell lung cancers in the People’s Republic ofChina. Lung Cancer (Auckl) 5, 1–9, 2014.
[6] Ekman S. How selecting best therapy for metastatic NTRK fusion-positive non-small cell lung cancer? Transl Lung Cancer Res. 2020 Dec;9(6):2535-2544.
[7] 2022版NCCN肠癌指南https://www.nccn.org/professionals/physician_gls/pdf/colon.pdf
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